分子对接预测H5亚型禽流感病毒的广谱中和表位 |
| |
引用本文: | 颜渊清,李少伟,杨春燕,罗文新,王明桥,陈毅歆,罗海峰,吴婷,张军,夏宁邵.分子对接预测H5亚型禽流感病毒的广谱中和表位[J].科学通报,2008,53(2):210-219. |
| |
作者姓名: | 颜渊清 李少伟 杨春燕 罗文新 王明桥 陈毅歆 罗海峰 吴婷 张军 夏宁邵 |
| |
作者单位: | 国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学) 厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学),厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学),厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学),厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学),厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学),厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学),厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学),厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学),厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学),厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,厦门361005,厦门361005,厦门361005,厦门361005,厦门361005,厦门361005,厦门361005,厦门361005,厦门361005,厦门361005 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金项目(批准号:30500092,30640017,30600106)、国家“十五”攻关项目(批准号:2004BA519A73)、国家科技支撑计划(批准号:2006BA101B06)、福建省重大科技专项(批准号:2004YZ01-1)和福建省重点科技项目(批准号:2005Y020)资助 致谢 感谢美国Scripps研究所的林天伟博士、新加坡国立大学的孔勇博士和韩晋华博士对本工作的指导和帮助. |
| |
摘 要: | H5N1禽流感病毒已经在亚洲、欧洲和非洲广泛传播, 造成了巨大损失. 最近我们鉴定出一株对多种来源的H5N1代表株均有良好中和活性的、识别H5亚型血凝素(hemagglutinin, HA)的广谱单克隆抗体8H5, 它对寻找克服禽流感高变性的广谱治疗性抗体、疫苗和药物具有重要价值. 本研究应用分子模拟技术, 采用“典范结构”方法对8H5抗体Fab片段进行结构模建, 并通过能量分析、SAS值分析、“拉曼强传图”检验、profile-3D分析等理论验证, 获得较为合理的8H5Fab的三维空间结构. 8H5Fab与3种HA蛋白晶体结构的分子对接结果表明, 8H5抗体与HA蛋白的作用模式与HA宿主来源无关, 但与HA结构的亚型相似性相关. 综合抗原同源比对结果, 推测8H5抗体识别的广谱中和表位是由HA上的Asp68, Asn72, Glu112, Lys113, Ile114, Pro118, Ser120, Tyr137, Tyr252不连续氨基酸残基组成的构象表位. 这一模型将为H5亚型禽流感病毒广谱疫苗和治疗性药物的分子设计提供依据.
|
关 键 词: | H5N1禽流感病毒 分子对接 血凝素蛋白 中和表位 |
收稿时间: | 2007-10-15 |
修稿时间: | 2007-12-26 |
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录! |
| 点击此处可从《科学通报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《科学通报》下载免费的PDF全文 |
|