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SVR—CKNN预测用于HIV-1蛋白酶抑制剂QSAR建模
引用本文:熊洁仪,袁哲明.SVR—CKNN预测用于HIV-1蛋白酶抑制剂QSAR建模[J].江西科学,2009,27(2):236-239.
作者姓名:熊洁仪  袁哲明
作者单位:湖南农业大学生物安全科学技术学院,湖南,长沙,410128
基金项目:国家自然科学基金,教育部新世纪优秀人才支持计划 
摘    要:为提高药物定量构效关系(QSAR)模型预测精度,发展了一种新的QSAR建模方法SVR—CKNN。该法基于支持向量机回归(SVR)自动筛选化合物结构描述符,以k-最近邻建立多个子模型实施组合预测(CKNN)。应用于49种HIV-1蛋白酶抑制剂QSAR研究,留一法预测结果表明SVR—CKNN预测精度明显优于多元线性回归(MLR)、逐步回归(SLR)、偏最小二乘回归(PLS)和神经网络(BP—ANN)等传统模型。SVR—CKNN基于结构风险最小,具非线性、适于小样本、泛化推广能力强、稳定性好、不依赖操作者经验等诸多优点,在药物设计等研究中应用前景广泛。

关 键 词:HIV-1蛋白酶抑制剂  支持向量机回归  定量构效关系  k-最近邻  组合预测

SVR-CKNN Applied in QSAR Model of HIV-1 Protease Inhibitors
XIONG Jie-yi,YUAN Zhe-ming.SVR-CKNN Applied in QSAR Model of HIV-1 Protease Inhibitors[J].Jiangxi Science,2009,27(2):236-239.
Authors:XIONG Jie-yi  YUAN Zhe-ming
Institution:College of Bio-safe Science and Technology;Hunan Agricultural University;Hunan Changsha 410128 PRC
Abstract:
Keywords:HIV-1 Protease Inhibitors  Support vector machine regression  QSAR  k-nearest neighbor  Combinatorial forecasting  
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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