| 基于拉普拉斯矩阵的DNA序列集相似性分析 |
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| 引用本文： | 秦洋,王立宏,武栓虎,宋宜斌.基于拉普拉斯矩阵的DNA序列集相似性分析[J].北京交通大学学报(自然科学版),2009,33(6). |
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| 作者姓名： | 秦洋 王立宏 武栓虎 宋宜斌 |
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| 作者单位： | 烟台大学,计算机学院,山东,烟台,264005;烟台大学,计算机学院,山东,烟台,264005;烟台大学,计算机学院,山东,烟台,264005;烟台大学,计算机学院,山东,烟台,264005 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，山东省自然科学基金资助项目(Y2008G08 |
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| 摘 要： | 研究两个序列集合之间相似性度量,提出基于拉普拉斯矩阵特征值的分离度概念和公式表示.基于人工序列和真实DNA序列上的实验结果,证实了分离度能够度量序列间的相似程度.
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| 关 键 词： | 拉普拉斯矩阵 启动子 DNA序列 相似性度量 |
Analysis of Similarity Between DNA Sequence Sets Based on Laplace Matrix |
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| QIN Yang,WANG Lihong,WU Shuanhu,SONG Yibin.Analysis of Similarity Between DNA Sequence Sets Based on Laplace Matrix[J].JOURNAL OF BEIJING JIAOTONG UNIVERSITY,2009,33(6). |
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| Authors: | QIN Yang WANG Lihong WU Shuanhu SONG Yibin |
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| Institution: | QIN Yang,WANG Lihong,WU Shuanhu,SONG Yibin(School of Computer,Yantai University,Yantai Sh,ong 264005,China) |
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| Abstract: | Similarity measure between two sequence sets are studied,and the concept,as well as the expression of a new divergence is proposed.Experiments on synthetic data and real DNA sequence sets show that this divergence can measure the similarity between sequence sets. |
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| Keywords: | Laplace Matrix promoter DNA sequence similarity measure |
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