人核受体nr5a2(hb1f )基因组序列的生物信息学分析 |
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引用本文: | 张成康,林伟,蔡彦宁,董辉,李嵋,付刚,谢幼华,黄谷杨,汪垣.人核受体nr5a2(hb1f )基因组序列的生物信息学分析[J].科学通报,2002,47(1):44-48. |
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作者姓名: | 张成康 林伟 蔡彦宁 董辉 李嵋 付刚 谢幼华 黄谷杨 汪垣 |
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作者单位: | [1]中国科学院上海生命科学研究院,中国科学院上海生物化学和细胞生物学研究所,上海200031 [2]国家人类基因组南方研究中心,上海201203 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(批准号:39893320-4),国家人类基因组南方中心(批准号:CNCS-98-M-06),国家重点基础研 |
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摘 要: | 在克隆了人核受体基因nr5a2(hblf)的 cDNA的基础上,测定了该基因的全基因组序列。采用生物信息学手段对nr5a2(hblf)基因组序列进行了深入分析。序列同源性比较及编码序列预测结果显示,在测定的210kb基因组序列中,特别是人nr5a2(hblf)基因的内含了中可能还存在其他的编码信息。通过比较基因组方法分析不同生物nr5a基因的结构,发现各种生物nr5a基因的结构具有保守性,并且在进化过程中有明显的基因重复现象。对斑马鱼、小鼠和人nr5a2基因上游序列的比较,显示这些生物nr5a基因的启动子区域相当保守,提示不同生物的nr5a2基因可能受到同一类转录因子的调控。
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关 键 词: | 人核受体 nr5a(hblf) 基因结构 生物信息学 比较基因组学 启动子 |
收稿时间: | 2001-07-23 |
修稿时间: | 2001年7月23日 |
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