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水稻籼粳杂种不育基因座Sc的遗传图
作者姓名:杨存义(  )  陈忠正()  庄楚雄()  梅曼彤()  刘耀光()
作者单位:[1]华南农业大学生命科学学院,广州510642/华南农业大学根系生物学中心,广州510642 [2]华南农业大学生命科学学院,广州510642
基金项目:本工作为国家重点基础研究发展规划(批准号G1999011603)、国家高技术研究发展计划(批准号:2001AA222011)、国家重大科技专项"功能基因组和生物芯片"(批准号:2002AA2Z1002)和国家自然科学基金(批准号:30170495)资助项目.
摘    要:杂种不育是水稻籼粳亚种间杂种优势利用的主要障碍. 为了克隆1个籼粳杂种不育基因Sc, 利用分子标记和近等基因系杂交产生的F2群体对Sc座位进行了精细定位. 初步的连锁分析结果表明, Sc座位与第3染色体的4个分子标记以RM218-RG369-Sc-RG227-RG391的关系连锁, 其中RG227与Sc座位之间的遗传距离为0.07 cM. 用RG227为起始探针筛选籼稻的TAC基因组文库, 并通过染色体步移构建了一个覆盖Sc座位的跨度约320 kb的克隆重叠群. 对可能覆盖Sc的2个TAC克隆M45E14和M90J01进行了部分测序. 用TAC克隆序列和RG227序列搜索水稻基因组序列数据库, 锚定了粳稻BAC克隆OSJNBb0078P24(148 kb)序列. 通过比较TAC和BAC克隆的序列, 在Sc座位区域发展了6个新的基于PCR的标记. 用这些标记进一步把Sc座位定位在一个约46 kb的区域内. 从定位结果推测该BAC克隆和TAC克隆M45E14包含Sc基因. 基因预测分析显示, 在此46 kb区域内有6个预测的ORF.

关 键 词:水稻 杂种不育  基因定位  物理图
收稿时间:2004-05-08
修稿时间:2004-06-21
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