| SARS冠状病毒主蛋白酶可切割多肽的搜索与生物信息学的应用 |
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| 引用本文： | 孙浩,杜奇石,王树青,谢军民,李大鹏.SARS冠状病毒主蛋白酶可切割多肽的搜索与生物信息学的应用[J].湘潭大学自然科学学报,2004,26(4):80-84. |
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| 作者姓名： | 孙浩 杜奇石 王树青 谢军民 李大鹏 |
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| 作者单位： | 天津师范大学,生物信息与药物开发研究所,天津,300074 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目 (2 0 3730 48)，天津市科委基础科学重点项目 (0 3380 1 91 1 ) |
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| 摘 要： | 用新近发展的冠状病毒的基因解析软件系统ZCURVE-CoV 1．0和ZCURVE-CoV2．0分析了基因库(NCBI RelSeq project)的27个不同来源的SARS冠状病毒的RNA基因序列，找出了主蛋白酶(CoV M^pre)在聚蛋白ppla和pplab中的297个酶切位点，在此基础上确定的11个SARS冠状病毒主蛋白酶的可切割八肽，这些八肽都含有SARS CoV M^pro的真实切割点，因而是发展SARS CoYM^pro的多肽类抑制剂的适宜出发点,计算了可切割八肽在特异性位点R2、Rl、和Rl上的氨基酸的分布慨率，发现位点R4和R3也有一定的特异性．分析了这些位点上的氨基酸的结构特征，找出了最有希望成为SAPS CoV M^pro的多肽类抑制剂的两个八肽NH2-ATLQ↓AIAS-COOH和NH2-ATLQ↓AENV-COOH，并探讨了对可切割八肽作化学修饰的思路，为SARS CoV M^pro的多肽类抑制剂和非肽类抑制剂的设计提供了基础,同时把生物信息学用于药物开发，探讨了从基因到药物的快捷通道。
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| 关 键 词： | SARS SARS冠状病毒主蛋白酶 多肽的剪切性 抑制剂 变形钥匙 |
| 文章编号： | 1000-5900(2004)04-0080-05 |
| 修稿时间： | 2004年9月13日 |
Application of Bioinformatics in Search of Cleavable Peptides of SARS CoV Mpro and Chemical Modification of Octapeptides |
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| SUN Hao,WANG Shuqing,XIE Junmin,LI Dapeng,DU Qishi.Application of Bioinformatics in Search of Cleavable Peptides of SARS CoV Mpro and Chemical Modification of Octapeptides[J].Natural Science Journal of Xiangtan University,2004,26(4):80-84. |
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| Authors: | SUN Hao WANG Shuqing XIE Junmin LI Dapeng DU Qishi |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | SARS SARS CoV M~(pro) Cleavable Peptide Inhibitor Distorted Key |
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