一株新型溶藻弧菌噬菌体φV039C的生物学特性和全基因组分析

对一株溶藻弧菌噬菌体φV039C进行了生物学特性和全基因组序列的研究。经透射电镜观察可见，噬菌体φV039C头部为正廿面体结构，直径58.9 nm，具长105.2 nm的尾部；采用双层平板法检测，其最佳感染复数为0.1；通过一步生长曲线计算可得，噬菌体φV039C的潜伏期为20 min，爆发期为10 min，裂解量为163 pfu/cell；利用第三代单分子测序平台进行全基因组测序分析，其基因组全长43 405 bp，G+C含量为42.95%,74个开放阅读框（ORF）主要为噬菌体的结构、DNA复制和裂解有关的基因；在NCBI数据库中进行基因组比对，发现与其最接近的长尾噬菌体科的溶藻弧菌噬菌体NF和副溶血弧菌噬菌体Seahorse的覆盖率仅为11%（覆盖区域的相似度分别为92.2%和93.3%）,此外，基于裂解酶构建的系统进化树也表明，φV039C与二者处于距离最近的分支。由此得出，溶藻弧菌噬菌体φV039C是一株新型的噬菌体，分类上应归属有尾噬菌体目长尾噬菌体科。