| 基于相对熵的蛋白质设计新方法 |
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| 引用本文： | 刘贇,王宝翰,王存新,陈慰祖.基于相对熵的蛋白质设计新方法[J].中国科学(G辑),2003,33(4):348-356. |
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| 作者姓名： | 刘贇 王宝翰 王存新 陈慰祖 |
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| 作者单位： | 1. 北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100022
2. 中国科学院生物物理研究所,北京,100101 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(批准号:10174005,30170230)，北京市自然科学基金(批准号:5032002 |
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| 摘 要： | 提出一个关于蛋白质设计的新的有效快速的优化方法, 其实质是按照Boltzmann分布搜索序列空间. 这一方法完全基于物理学原理, 在该方法中使用了相对熵的概念, 并把它作为优化的目标函数. 利用真实蛋白质的非格子模型对该方法进行了检验. 与同类工作相比, 得到了较好的结果. 该方法可以作为处理蛋白质折叠和逆折叠的统一框架.
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| 关 键 词： | 相对熵 非格子模型 蛋白质设计 |
| 收稿时间： | 2003-02-17 |
| 修稿时间： | 2003-06-21 |
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