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BioStarM-140s芯片基因信息查询系统的构建及应用
引用本文:陆慧琴,吕晓迎,包翔,马慧敏.BioStarM-140s芯片基因信息查询系统的构建及应用[J].东南大学学报(自然科学版),2006,36(4):647-651.
作者姓名:陆慧琴  吕晓迎  包翔  马慧敏
作者单位:东南大学生物电子学国家重点实验室,南京,210096
基金项目:国家自然科学基金,国家科技攻关项目
摘    要:应用生物信息学数据库查询的方法,对B ioS tarM-140s小鼠基因表达芯片上的14 112个基因进行相应注释信息的查询和所对应蛋白质功能的分类.首先参照人类综合型芯片上基因的功能分类,设定了14个蛋白质类别,然后采用V isual C 编程语言,构建了基因信息查询系统.应用该查询系统,进行了网络生物学数据库信息资源的自动直接查询,共搜索到有注释信息的基因12 070个;进一步按照所设定的14个蛋白质类别对12 070个基因进行分类查询,搜索到了与这14个分类相符合的、具有详细蛋白质功能注释信息的基因共1 606个.

关 键 词:生物信息学  数据库查询  基因表达芯片
文章编号:1001-0505(2006)04-0647-05
收稿时间:01 13 2006 12:00AM
修稿时间:2006-01-13

Construction and application of searching system on BioStarM-140s microarray
Lu Huiqin,Lü Xiaoying,Bao Xiang,Ma Huimin.Construction and application of searching system on BioStarM-140s microarray[J].Journal of Southeast University(Natural Science Edition),2006,36(4):647-651.
Authors:Lu Huiqin  Lü Xiaoying  Bao Xiang  Ma Huimin
Institution:State Key Laboratory of Bioelectronics, Southeast University, Nanjing 210096, China
Abstract:
Keywords:bioinformatics  database searching  gene expression microarray
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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