| 生化反应系统的加速τ-Leap模拟算法 |
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| 引用本文： | 衣娜,庄刚,王翼飞.生化反应系统的加速τ-Leap模拟算法[J].应用科学学报,2011,29(2). |
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| 作者姓名： | 衣娜 庄刚 王翼飞 |
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| 作者单位： | 上海大学,数学系,上海,200444 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(No.30971480):国家科技重大专项基金，上海市教委重点学科建设项目基金(No.J50101):上海市重点学科建设项目基金 |
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| 摘 要： | 该文重新定义了临界反应,以更合理地界定可能出现负分子组分的反应.在此基础上提出了加速τ-leap算法,使系统中某些反应物数目较少时也可以采用τ-leap方法进行模拟,同时提高了模拟速度.以两个生化反应系统模型为例,分别用精确的随机模拟算法、修正τ-leap算法和加速τ-leap算法进行模拟运算,结果表明加速τ-leap算法在保证精度的同时能有效提高模拟速度.
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| 关 键 词： | 步长选择策略 临界反应 τ-leap算法 随机模拟算法 生化反应系统 |
The Accelerated τ-Leap Simulation Method for Biochemical Reaction Systems |
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| YI Na,ZHUANG Gang,WANG Yi-fei.The Accelerated τ-Leap Simulation Method for Biochemical Reaction Systems[J].Journal of Applied Sciences,2011,29(2). |
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| Authors: | YI Na ZHUANG Gang WANG Yi-fei |
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| Institution: | YI Na,ZHUANG Gang,WANG Yi-fei Department of Mathematics,Shanghai University,Shanghai 200444,China |
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