杜鹃AQP基因家族的鉴定与生物信息学分析

为了研究杜鹃水通道蛋白基因家族的生物学功能,本研究利用生物信息学方法在杜鹃基因组中鉴定了35个水通道蛋白基因。基因位置分析水通道蛋白基因在杜鹃13条染色体上不均匀分布。聚类分析显示杜鹃水通道蛋白可以分为5个亚家族（PIP、TIP、NIP、SIP和XIP）。启动子响应元件分析发现大部分AQP基因启动子区所含元件与激素调节、光响应和抗逆胁迫等密切相关。共线性分析表明有4对AQP基因出现了片段重复;Ka/Ks（同义替换/非同义替换）结果显示均小于1,表明这些基因经历了较强的纯化选择。本研究为了解杜鹃水通道蛋白家族的功能提供了理论基础。