nifA突变的苜蓿根瘤菌在根瘤中的转录组学分析 |
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作者姓名: | 田哲贤 邹华松 李健 张远涛 刘影 俞冠翘 朱家璧 Silvia Rüberg Anke Becker 王忆平 |
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作者单位: | 1. 北京大学生命科学学院,蛋白质工程暨植物基因工程国家重点实验室,北京,100871 2. 中国科学院上海生命科学学院上海植物生理及生态研究所,植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032 3. Lehrstuhl für Genetik,Universit(a)t Bielefeld,Postfach 100131,33501 Bielefeld,Germany |
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基金项目: | 致谢 本工作为国家重点基础研究发展计划(批准号:2001CB108901和2001CB108902)、国家自然科学基金(批准号:30470940)及德国Bundesministerium für Bildung und Forschung(批准号:031U213D)和Deutsche Forschungsge-meinschaft(批准号:BIZ7)资助项目. |
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摘 要: | 用全基因组微阵列比较了根瘤中苜蓿根瘤菌1021的nifA突变菌和野生菌的基因表达谱. 分析结果表明, nifA的缺失引起601个基因的表达发生变化. 这些基因分别属于生物大分子的合成代谢、三羧酸循环及呼吸代谢以及结瘤固氮过程等多个功能组, 预示着根瘤中细菌的生长状态发生了显著的变化. 在根瘤中, fixK以及受其激活的基因在nifA突变菌中的表达量显著高于野生菌. 定量实时PCR分析表明, 根瘤中fixLJ的转录水平在nifA突变菌中显著高于野生菌. 通过统计学方法从13个表达发生显著变化的基因的上游调控序列中找到推测的NifA结合位点.
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关 键 词: | 转录组 NifA FixJ 根瘤细菌 |
收稿时间: | 2006-04-20 |
修稿时间: | 2006-04-202006-06-20 |
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