禾谷炭疽菌中剪接因子SR蛋白的生物信息学分析及基因克隆

Serine/arginine-rich(SR)蛋白参与前体mRNA剪接及mRNA代谢等多种生理生化活动。以裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)中两个典型SR蛋白序列为基础，利用Blastp和关键词对禾谷炭疽菌蛋白质数据库进行比对分析，明确该菌中具有2个SR蛋白CgSrp1和CgSrp2;通过SMART保守结构域分析，明确CgSrp1和CgSrp2蛋白的N端都含有RNA识别结构域，C端含有丝氨酸/精氨酸二肽序列；利用NCBI中BLASTp程序与其他物种进行相似性分析，构建系统进化树，并通过氨基酸序列比对发现SR蛋白在植物和真菌之间的差异性；同时，通过对CgSrp1和CgSrp2蛋白的理化性质、疏水性、亚细胞定位及二、三级结构等进行生物信息学分析，明确CgSrp1和CgSrp2都是亲水性蛋白质，二者均定位于细胞核，含有α螺旋、β折叠和无规则卷曲三种结构；以野生型禾谷炭疽菌CgM2为模板，成功克隆了CgSRP1和CgSRP2基因片段，明确CgM2存在CgSRP1和CgSRP2基因。