| 短链蝎毒素BmK38的1H-NMR谱峰归属、二级结构分析及溶液构象 |
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| 引用本文： | 蔡征许琛琦吴季辉徐应祺戚正武[2,3] 施蕴渝. 短链蝎毒素BmK38的1H-NMR谱峰归属、二级结构分析及溶液构象[J]. 中国科学技术大学学报, 2006, 36(7): 685-694 |
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| 作者姓名： | 蔡征许琛琦吴季辉徐应祺戚正武[2 3] 施蕴渝 |
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| 作者单位： | [1]中国科学技术大学生命科学学院结构生物学开放实验室,安徽合肥230027 [2]中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所,上海200031 [3]同济大学蛋白质研究所,上海200092 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划);中国科学院资助项目;国家创新研究群体科学基金;高比容电子铝箔的研究开发与应用项目;中国科学院知识创新工程项目 |
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| 摘 要： | BmK38是最近从东亚钳蝎（Buthus martensi Karsch,BmK）中分离纯化得到的一种短链蝎毒素．应用2D-NMR技术研究BmK38的溶液构象,通过分析其在水溶液中的DQF-COSY、TOCSY和NOESY等1^H—NMR谱,识别了BmK38全部40个氨基酸残基的自旋体系,并通过分析NOESY谱图中dαN、dNN、dβN的联系,完成了序列专一性谱峰归属,标定了全部主链质子和绝大部分侧链质子的化学位移．根据谱峰归属的结果和NMR数据分析了BmK38的二级结构组成并且计算出BmK38的溶液构象．结构计算的结果与前述二级结构的分析是一致的．结果表明,肽段Gln8-Arg17形成α螺旋,而肽段Gly22-Glu29以及Leu32-CYS39构成反平行的口折叠,属于典型的短链蝎毒素的折叠形式．通过与其他OUKTx短链蝎毒素的结构比较,讨论了BmK38的结构特异性以及结构功能的相互关系．
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| 关 键 词： | 短链蝎毒素 二维核磁共振 序列专一性归属 二级结构 溶液构象 |
| 文章编号： | 0253-2778(2006)07-0685-10 |
| 收稿时间： | 2004-09-08 |
| 修稿时间： | 2005-10-28 |
Sequence-specific assignments of proton NMR resonance peaks,analysis of secondary structural elements and solution conformation of BmK38 |
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| CAI Zheng, XU Chen-qi, WU Ji-hui, XU Ying-qi, QI Zheng-wu, SHI Yun-yu. Sequence-specific assignments of proton NMR resonance peaks,analysis of secondary structural elements and solution conformation of BmK38[J]. Journal of University of Science and Technology of China, 2006, 36(7): 685-694 |
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| Authors: | CAI Zheng XU Chen-qi WU Ji-hui XU Ying-qi QI Zheng-wu SHI Yun-yu |
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| Affiliation: | 1. Laboratory of Structural Biology, School of Life Science, University of Science and Technology of China, Hefei 230027, China; 2. Shanghai Institute of Biochemistry and Cell Biology, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031 ,China; 3. Institute of Protein Research, Tongji University, Shanghai 200092, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | BmK38 short-chain scorpion toxin 2D-NMR sequence-specific assignment secondary structural elements solution structure |
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