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| 表皮葡萄球菌双组分调控系统的生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 秦智强,钟扬,张健,何有裕,吴旸,江娟,陈洁敏,罗小民,瞿涤.表皮葡萄球菌双组分调控系统的生物信息学分析[J].科学通报,2004,49(10):948-952. |
| 作者姓名： | 秦智强 钟扬 张健 何有裕 吴旸 江娟 陈洁敏 罗小民 瞿涤 |
| 作者单位： | 1. 复旦大学医学院教育部卫生部分子病毒重点实验室,上海,200032 2. 复旦大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部,重点实验室,上海,200433;上海生物信息技术研究中心,上海,200235 3. 中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心,上海,201203 4. 中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心,上海,200031 |
| 基金项目： | 本工作为国家高技术研究发展计划 (批准号: 2001AA223011)、国家重点基础研究发展规划 (批准号: 2002CB5128)和上海市科技发展基金(批准号: 02DJ14002)资助项目. |
| 摘 要： | 应用序列同源性比较及功能域分析等生物信息学手段, 从表皮葡萄球菌全基因组序列中发现16对双组分调控系统以及2个相对保守的功能域(HATPase_c和REC). 通过与金黄色葡萄球菌和枯草杆菌中的双组分调控系统基因比较, 预测表皮葡萄球菌中同源双组分调控系统基因可能具有参与调控细菌生长、生物膜形成、毒力因子表达等重要生物学功能. 对16对双组分调控系统基因的2个保守性功能域进行空间结构模建, 获得4个相似的组氨酸蛋白激酶HATPase_c功能域模拟结构以及13个相似的反应调节蛋白REC功能域模拟结构, 其中HATPase_c结构在AMP-PNP的结合部位形成袋状结构, 而REC结构中均包含3个天冬氨酸活性位点. 初步实验结果表明表皮葡萄球菌双组分调控系统保守性功能域的生物信息学分析可以为进一步开发相关治疗药物提供潜在的靶标. |
| 关 键 词： | 表皮葡萄球菌 双组分调控系统 组氨酸蛋白激酶 反应调节蛋白 生物信息学 药物靶标 |
| 收稿时间： | 2004-02-18 |
| 修稿时间： | 2004-05-08 |
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