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集胞蓝细菌PCC 6803中非生物胁迫响应的核心基因分析
作者姓名:程亚蕊  黄世鹏  张天缘  张建猛  王锋尖
作者单位:1. 汉江师范学院化学与环境工程学院;2. 华中农业大学生命科学技术学院
摘    要:以集胞蓝细菌PCC 6803的多组转录组数据为对象,鉴定蓝细菌在非生物胁迫下共同表达的核心差异基因(CDGs)).结果表明,9个对氮、铁、碳、磷缺乏响应的CDGs被鉴定.京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析表明,氮代谢、ABC转运蛋白和氨基酸代谢与营养缺乏有关.研究还鉴定了热激处理下共同表达的CDGs,并且代谢通路ABC转运蛋白和碳固定也与热胁迫相关.同时构建了CDGs的蛋白质-蛋白质相互作用网络,以预测基因在应对胁迫可能的响应机制.这些候选基因库将有助于加速理解蓝细菌在应激中的调控模式.

关 键 词:集胞蓝细菌PCC 6803  非生物胁迫  核心差异基因  KEGG  蛋白互作
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