| 摘 要： | ![]()
通过生物信息学方法鉴定番茄基因组上的bZIP转录因子(SlbZIP),为研究番茄bZIP转录因子提供相关信息以及为低温胁迫下的候选基因预测提供参考.通过Pfam下载bZIP隐马尔科夫模型bZIP＿1(PF00170),利用HMMER 3.0鉴定番茄bZIP转录因子，并从Plant PFDB数据库中获取其理化性质等信息.使用Clustal W、MEGA11.0、TBtools和MEME等在线软件对其蛋白序列进行生物信息学分析.通过与拟南芥的bZIP转录因子家族进行系统进化树分析，将番茄bZIP分为13个亚族(A—I和S、X、Z).染色体定位分析显示，番茄bZIP转录因子不平均分布在12条染色体上.保守基序和进化树分析表明，同一亚族同一分支的转录因子基序类型大致相同，预示同一分支的转录因子功能可能相似.未知功能的番茄bZIP转录因子蛋白二级结构和三级结构预测表明，番茄bZIP转录因子蛋白以无规则卷曲和α螺旋为主，且占比较大，此类结构对番茄bZIP转录因子蛋白功能的发挥有重要作用.未知功能的番茄bZIP转录因子与拟南芥的进化树表明，10个番茄bZIP转录因子与拟南芥中能够抵御低温胁迫的转录因...
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