| 在铜绿假单胞菌PAO1和PA14中确定基因岛的新方法 |
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| 引用本文： | 宋磊,张雪洪.在铜绿假单胞菌PAO1和PA14中确定基因岛的新方法[J].科学通报,2009,54(20):3198-3206. |
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| 作者姓名： | 宋磊 张雪洪 |
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| 作者单位： | 教育部微生物代谢重点实验室, 上海交通大学生命科学技术学院, 上海 200240;
上海师范大学生命与环境科学学院, 上海 200234 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(批准号: 30821005, 30870075)、国家重点基础研究发展计划(编号: 2009CB118906)和上海市重点学科(批准号: B203)资助项目 |
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| 摘 要： | 基于基因岛的3种显著特点, 建立了一种新的确定基因岛的方法, 能够较为全面地搜寻特定菌株的基因岛. 以此方法在Pseudomonas aeruginosa PA14和Pseudomonas aeruginosa PAO1中共发现了9个基因岛, 在PAO1中发现2个, 在PA14中发现7个, 其中有4个是已经被研究鉴定, 5个是新发现的基因岛. 9个基因岛中, 有6个的插入位点是tRNA基因, 而其余的3个基因岛中有1个正向重复序列同tRNA基因相关, 1个的正向重复序列是在GMP合酶/谷氨酰胺氨基转移酶双功能酶的3′末端, 只有1个的正向重复序列尚不清楚来源. 对5个未被鉴定的基因岛进行内部基因的功能分析, 预测PA14GI-2是同汞离子摄取相关的基因岛, PA14GI-3是同分泌相关的基因岛, PA14GI-6是毒力岛. 而PA14GI-1和PA14GI-5功能尚不清楚. 对PAO1GI-1, PA14GI-5和PA14GI-7中的整合酶进行分析, 预测了各基因岛的酶切位点和结合位点.
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| 关 键 词： | 铜绿假单胞菌 基因岛 基因水平转移 比较基因组分析 整合酶 |
| 收稿时间： | 2009-04-27 |
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