| 基于粒子群算法的骨性关节炎药物分子对接方法应用研究 |
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| 作者姓名： | 李惠忠 叶少珍 |
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| 作者单位： | 1.福州大学数学与计算机科学学院,福建 福州 350116;2.福建省医疗器械与医药技术重点实验室,福建 福州 350002 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(61104041,61201397);福建省自然科学基金资助项目(2009J01282,2012J01261) |
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| 摘 要： | 通过改进分子对接软件AutoDock的构象搜索算法对治疗骨性关节炎的中药分子进行对接研究.简要分析分子对接方法的基本原理,建立分子对接数学模型,介绍AutoDock半经验结合自由能评分函数;将粒子群算法与自适应局部搜索策略相结合改进了分子对接构象搜索过程;以福建中医大学提供的治疗骨性关节炎的中药分子实验数据为基础,完成了此算法与拉马克遗传算法、遗传算法以及本课题组使用的蚁群算法在最低能量值、对接精度以及对接耗时上的比较实验.实验结果验证了粒子群算法应用在对接构象搜索上的有效性.
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| 关 键 词： | 分子对接 骨性关节炎函数 粒子群算法 自适应局部搜索 |
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