肝细胞癌铜死亡标志物SLC31A1、DBT的鉴定及化合物筛选

探究铜死亡相关基因对肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)的影响，并挖掘治疗HCC的活性成分。通过GEO数据库下载GSE84402数据集，获取肝癌差异表达基因，通过文献检索铜死亡相关基因，两者取交集获得肝癌相关铜死亡基因。进一步分析交集基因，使用UALCAN分析其差异表达，R语言分析其表达水平与临床的相关性，Kaplan-Meier Plortter分析其预后价值，HCMDB分析其与肝癌转移的关系，并使用THPA分析其与肝癌的病理关系。最后进行化合物预测与分子对接。结果表明，与正常组相比，铜死亡关键基因SLC31A1、DBT在肿瘤中表达水平下调，病理分析显示其蛋白在HCC组织中表达增加，且与临床相关性变量性别、肿瘤分期、淋巴结转移显著相关，其高表达与肝癌预后良好相关，其中SLC31A1低表达与肝癌向肾上腺、肺部转移显著相关。最后筛选出可能与SLC31A1、DBT结合的活性化合物，其中白藜芦醇、叶酸对接分数高。研究认为铜死亡相关基因SLC31A1、DBT在HCC的发生发展中起重要作用，为HCC的诊断及治疗药物研究提供了新思路。