| 尾细桉生长和木材密度关联SNP挖掘与候选基因定位 |
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| 引用本文： | 朱显亮,周长品,贾翠蓉,翁启杰,李发根. 尾细桉生长和木材密度关联SNP挖掘与候选基因定位[J]. 南京林业大学学报(自然科学版), 2021, 45(4): 143. DOI: 10.12302/j.issn.1000-2006.202004003 |
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| 作者姓名： | 朱显亮 周长品 贾翠蓉 翁启杰 李发根 |
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| 作者单位： | 中国林业科学研究院热带林业研究所, 热带林业研究国家林业和草原局重点实验室,广东 广州 510520 |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金项目(2020A1515010974);中国林科院基本科研业务费专项(CAFYBB2017MA006) |
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| 摘 要： | 【目的】生长和木材基本密度是桉树的重要经济性状,挖掘其候选功能基因可为桉树遗传改良提供参考。【方法】以尾叶桉(Eucalyptus urophylla)和细叶桉(Eucalyptus tereticornis) F1全同胞子代试验林为研究对象,测定其8年生树高、胸径和木材基本密度,开展表型遗传分析。筛选极端表型个体,利用测序分型(GBS)开发SNP标记进行关联分析。挖掘与树高、胸径和木材基本密度关联的SNP位点,并进行候选基因初步定位。【结果】尾细桉F1子代树高、胸径与木材基本密度间的表型变异系数为7.51%~26.19%,生长性状与木材基本密度显著正相关。利用GBS获得了覆盖全基因组的15 185个SNP位点,关联分析共鉴定111个与生长和木材基本密度显著关联的SNP,其中2号染色体上检测到强烈的生长性状关联信号。定位40个与生长和木材基本密度相关候选基因,共富集在52个GO terms,基因功能注释分析表明其功能主要与植物抗逆性、生物与非生物胁迫、转录因子家族等相关。【结论】本研究获得了一批与尾细桉生长和材性性状关联的SNP位点和候选基因,并进行了树高、胸径及木材基本密度候选基因初步定位,挖掘的与抗逆性相关的基因可能在树木的生长和木材形成中发挥重要作用。
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| 关 键 词： | 尾细桉 测序分型 单核苷酸多态性(SNP) 表型性状 关联分析 候选基因 |
| 收稿时间： | 2020-04-04 |
Association of SNP loci and candidate genes for growth and wood density in Eucalyptus urophylla × E. tereticornis |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Eucalyptus urophylla×E. tereticornis genotyping by sequencing single nucleotide polymorphism(SNP) phenotypic character association analysis candidate genes |
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