与含卫星DNA的烟草曲茎病毒伴随的nanovirus类DNA分子鉴定 |
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引用本文: | 吴佩君,谢艳,陶小荣,周雪平.与含卫星DNA的烟草曲茎病毒伴随的nanovirus类DNA分子鉴定[J].自然科学进展,2004,14(6):655-659. |
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作者姓名: | 吴佩君 谢艳 陶小荣 周雪平 |
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作者单位: | 浙江大学生物技术研究所,杭州,310029 |
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摘 要: | 利用已报道的两种粉虱传双生病毒DNA1分子的全长特异性引物进行PCR扩增,在含有卫星DNAβ的烟草曲茎病毒(TbCSV)Y35和Y115分离物中扩增到一种单链环状DNA小分子(命名为DNA1),而在不含有卫星DNAβ的TbCSV Y1和Y121分离物中没有扩增到DNA1分子. 免疫捕获PCR表明DNA1分子包裹在双生病毒粒子中. Southern blot检测进一步证实仅在含卫星DNAβ的TbCSV Y35和Y115分离物中存在DNA1分子. 序列分析表明,Y35 和Y115 DNA1序列全长分别为1367和1368?nt,各有一个较保守的开放阅读框(ORF),编码类似nanovirus 的Rep蛋白. 两个DNA1分子与辅助病毒DNA-A序列无同源性. Y35和Y115 DNA1全长核苷酸序列同源性为92%,ORF编码的氨基酸同源性为96%,而与已报道的胜红蓟黄脉病毒和木尔坦棉花曲叶病毒的DNA1的核苷酸序列同源性为70%~79%,氨基酸序列同源性为87%~90%. 将DNA1与nanoviruses DNA比较后发现,两者有较远的亲缘关系.
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关 键 词: | DNA1 DNAβ nanovirus 烟草曲茎病毒 |
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