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大熊猫核糖体蛋白S15A亚基基因(rps15A)的克隆及序列分析
引用本文:李俊,丁祥,侯怡铃,孙冰,苏秀兰,吴光富,宋嫣,侯万儒.大熊猫核糖体蛋白S15A亚基基因(rps15A)的克隆及序列分析[J].四川大学学报(自然科学版),2011,48(6):1456-1462.
作者姓名:李俊  丁祥  侯怡铃  孙冰  苏秀兰  吴光富  宋嫣  侯万儒
作者单位:西华师范大学生命科学学院,南充,637002
基金项目:国家自然科学基金(30470261);四川省应用基础项目(2009JY0061);四川省教育厅青年基金项目(092B088)
摘    要:根据已报道的部分物种的核糖体蛋白S15A亚基基因(rps15A)的相关信息设计引物, 运用RTPCR和TouchdownPCR技术, 分别克隆了大熊猫核糖体蛋白S15A亚基的cDNA和结构基因序列, 并进行测序及分析. 结果表明: 大熊猫核糖体蛋白S15A亚基基因的表达序列全长为460 bp,开放阅读框(ORF)为393 bp, 编码130个氨基酸, 结构基因序列全长为6091 bp, 含有4个外显子和3个内含子. RPS15A蛋白的相对分子质量为14.84 kD, pI为10.62. 拓扑预测显示含有5个类型的功能位点, 即: 1个依赖cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位点, 2个蛋白激酶C磷酸化位点, 1个乙酰化位点, 1个N 糖基化位点及1个核糖体蛋白S8 signature位点. 进一步对RPS15A蛋白的结构分析及其与部分脊椎动物和果蝇RPS15A蛋白的同源性分析, 发现该基因的表达序列及其编码的氨基酸序列具有很高的相似性, 这表明真核生物核糖体蛋白亚基S15A在进化中具有较高的保守性.

关 键 词:大熊猫  rps15A    克隆    序列分析

Cloning and sequence analysis of ribosomal protein S15A (rps15A) gene from the giant panda (Ailuropoda melanoleuca)
LI Jun,DING Xiang,HOU Yi-Ling,SUN Bing,SU Xiu-Lan,WU Guang-Fu,SONGYan,HOU Wan-Ru.Cloning and sequence analysis of ribosomal protein S15A (rps15A) gene from the giant panda (Ailuropoda melanoleuca)[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2011,48(6):1456-1462.
Authors:LI Jun  DING Xiang  HOU Yi-Ling  SUN Bing  SU Xiu-Lan  WU Guang-Fu  SONGYan  HOU Wan-Ru
Institution:College of Life Science, China West Normal University;College of Life Science, China West Normal University;College of Life Science, China West Normal University;College of Life Science, China West Normal University;College of Life Science, China West Normal University;College of Life Science, China West Normal University;College of Life Science, China West Normal University;College of Life Science, China West Normal University
Abstract:
Keywords:
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