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长非编码RNA与SAFB1相互作用中RNA二级结构的作用
引用本文:李晓杰,缪辉,王迪,詹浩淼,王琳琳,吴传芳.长非编码RNA与SAFB1相互作用中RNA二级结构的作用[J].四川大学学报(自然科学版),2019,56(4):743-748.
作者姓名:李晓杰  缪辉  王迪  詹浩淼  王琳琳  吴传芳
作者单位:四川大学生命科学学院 功能基因组实验室,四川大学生命科学学院 功能基因组实验室,四川大学生命科学学院 功能基因组实验室,四川大学生命科学学院 功能基因组实验室,四川大学生命科学学院 功能基因组实验室,四川大学生命科学学院 功能基因组实验室
基金项目:国家自然科学基金(81490752)
摘    要:为探究RNA与SAFB1蛋白相互作用过程中RNA二级结构的作用.采用足迹法确定SAFB1与LINC-PINT-1特定的结合区域,在此基础上根据RNA结构分析研究SAFB1结合区域所具有特定的二级结构.最后通过凝胶迁移率实验论证该二级结构在RNA与SAFB1蛋白结合中的作用.结果显示:在针对LINC-PINT-1的亚克隆发现只有包含30~55 nt区域的亚克隆才能维持RNA结合区域的二级结构,并且证实了LINC-PINT-1与SAFB1蛋白相互作用依赖于特定的RNA二级结构.结果表明:长非编码RNA与SAFB1蛋白相互作用或依赖于特定的RNA二级结构,本研究为RNA与蛋白质相互作用的分子机制研究提供了有力的理论实验支撑.

关 键 词:RNA    SAFB1蛋白    RNA二级结构    亚克隆    凝胶迁移率
收稿时间:2018/5/18 0:00:00
修稿时间:2018/5/23 0:00:00

The role of RNA secondary structure in the interaction between lncRNA and SAFB1
LI Xiao-Jie,MIAO Hui,WANG Di,ZHAN Hao-Miao,WANG Lin-Lin and WU Chuan-Fang.The role of RNA secondary structure in the interaction between lncRNA and SAFB1[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2019,56(4):743-748.
Authors:LI Xiao-Jie  MIAO Hui  WANG Di  ZHAN Hao-Miao  WANG Lin-Lin and WU Chuan-Fang
Institution:Department of Functional Genome, College of Life Science, Sichuan University,Department of Functional Genome, College of Life Science, Sichuan University,Department of Functional Genome, College of Life Science, Sichuan University,Department of Functional Genome, College of Life Science, Sichuan University,Department of Functional Genome, College of Life Science, Sichuan University,Department of Functional Genome, College of Life Science, Sichuan University
Abstract:
Keywords:
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