| 簸箕柳AP2/ERF家族基因的全基因组分析 |
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| 引用本文： | 田应明,王皆恒,沈方圆,李校.簸箕柳AP2/ERF家族基因的全基因组分析[J].四川大学学报(自然科学版),2019,56(5):983-988. |
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| 作者姓名： | 田应明 王皆恒 沈方圆 李校 |
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| 作者单位： | 四川大学生命科学学院 四川省分子生物与生物技术重点实验室,四川大学生命科学学院 四川省分子生物与生物技术重点实验室,四川大学生命科学学院 四川省分子生物与生物技术重点实验室,四川大学生命科学学院 四川省分子生物与生物技术重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（61001149） |
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| 摘 要： | 为了研究簸箕柳AP2/ERF转录因子家族的成员和分类,及后续深入探究其在簸箕柳生长发育过程中的功能,本文基于簸箕柳基因组数据,利用生物信息学技术和方法,对簸箕柳的AP2/ERF家族基因进行鉴定、分类及染色体定位,并对其理化性质、基因结构、保守结构域、表达模式等进行分析.结果表明,簸箕柳含有178个AP2/ERF家族基因,并根据AP2/ERF保守域的数量与拟南芥AP2/ERF家族基因的进化关系将其划分成AP2、ERF、RAV和Soloist亚家族4类.此外组织表达模式分析结果显示,簸箕柳AP2/ERF家族基因的表达具有明显的组织特异性,且在leaf、root、shoot、flower中表达较强,在其他组织中表达较弱.
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| 关 键 词： | 簸箕柳 AP2/ERF转录因子 生物信息学 表达模式 |
| 收稿时间： | 2018/9/25 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/5/17 0:00:00 |
Genome-wide analysis of the AP2/ERF family genes in Salix suchowensis |
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| TIAN Ying-Ming,WANG Jie-Heng,SHEN Fang-Yuan and LI Xiao.Genome-wide analysis of the AP2/ERF family genes in Salix suchowensis[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2019,56(5):983-988. |
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| Authors: | TIAN Ying-Ming WANG Jie-Heng SHEN Fang-Yuan and LI Xiao |
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| Institution: | Sichuan Key Laboratory of Molecular Biology and Biotechnology, College of Life Sciences, Sichuan University,Sichuan Key Laboratory of Molecular Biology and Biotechnology, College of Life Sciences, Sichuan University,Sichuan Key Laboratory of Molecular Biology and Biotechnology, College of Life Sciences, Sichuan University,Sichuan Key Laboratory of Molecular Biology and Biotechnology, College of Life Sciences, Sichuan University |
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