| 番茄黄化曲叶病毒北京分离物的全基因组序列测定及进化分析 |
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| 引用本文： | 芦佳,刘健,王慧,肖雅文,李常保,曹鸣庆,徐杰,姚磊.番茄黄化曲叶病毒北京分离物的全基因组序列测定及进化分析[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2014(3):273-280. |
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| 作者姓名： | 芦佳 刘健 王慧 肖雅文 李常保 曹鸣庆 徐杰 姚磊 |
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| 作者单位： | 内蒙古师范大学生命科学与技术学院;北京市农林科学院农业生物技术研究中心;北京市农林科学院蔬菜研究中心; |
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| 基金项目： | 北京市科技计划项目(D111100001311002);国家自然基金项目(30860063) |
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| 摘 要： | 番茄黄化曲叶病(tomato yellow leaf curl disease,TYLCD)在我国危害日益严重.为了对该病进行深入有效的了解,根据已知的番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)基因组DNA-A序列的保守区段,设计两对背向引物;针对北京地区的3个TYLCV分离物进行分子鉴定.结果显示该分离物为单组分病毒,不含DNA-B和卫星DNA-β,是TYLCV的2个新分离物.TYLCV-BJ1与BJ2基因组全长分别为2781bp和2779bp,同源性为99.8%,都编码6个开放阅读框.对TYLCV的分子进化分析表明,国内现已发现的TYLCV株系亲缘关系都很接近,同源性在97.1~99.9%,属于以色列TYLCV-IL株系进化下的一个近代分支.从全基因组和各基因的逐个比对结果看,TYLCV的AV1和AV2保守性最高,其次是AC2和AC3.当TYLCV-Mld进化成TYLCV-IL时,AC1和AV4基因发生了较大的变化,IR区的同源性更是从小于70%上升到94.3%.国内的TYLCV株系分成2个亚群,但在地理分布上没有形成严格的区域限定,北京分离物属于CN I亚群.
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| 关 键 词： | 番茄黄化曲叶病毒 分子检测 序列分析 进化 |
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