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小麦高分子量麦谷蛋白亚基1By15N端区同源建模与分子动力学模拟
引用本文:杨曦,黄伟伟,杨广笑,汪越胜,何光源.小麦高分子量麦谷蛋白亚基1By15N端区同源建模与分子动力学模拟[J].河南科技大学学报(自然科学版),2009,30(1).
作者姓名:杨曦  黄伟伟  杨广笑  汪越胜  何光源
作者单位:1. 河南科技大学,医学技术与工程学院,河南,洛阳,471003
2. 华中科技大学,中英HUST-RRes基因工程和基因组学联合实验室,湖北,武汉,430074
基金项目:国家重点基础研究发展规划(973计划),国家自然科学基金 
摘    要:通过二级结构预测、折叠识别、同源建模和分子动力学模拟的方法,获得三个小麦高分子量麦谷蛋白亚基1By15 N端区的三维结构模型.模型分析发现,y 型高分子量麦谷蛋白亚基N端的5个半胱氨酸具有两种成键模式,一种是Cys22和Cys44之间形成一个链内二硫键,N端剩余的三个半胱氨酸Cys10,45和55都是自由半胱氨酸用于形成链间二硫键;另一种是Cys22和Cys44,Cys10和Cys55之间形成两对链内二硫键,剩余一个Cys45作为自由半胱氨酸用于形成链间二硫键.

关 键 词:小麦  麦谷蛋白  同源建模  分子动力学模拟  二硫键

Homology Modeling and Molecular Dynamics Simulations of N-terminal Domain of Wheat High Molecular Weight Glutenin Subunit 1By15
YANG Xi,HUANG Wei-Wei,YANG Guang-Xiao,WANG Yue-Sheng,HE Guang-Yuan.Homology Modeling and Molecular Dynamics Simulations of N-terminal Domain of Wheat High Molecular Weight Glutenin Subunit 1By15[J].Journal of Henan University of Science & Technology:Natural Science,2009,30(1).
Authors:YANG Xi  HUANG Wei-Wei  YANG Guang-Xiao  WANG Yue-Sheng  HE Guang-Yuan
Institution:1.Medical Technology & Engineering College;Henan University of Science & Technology;Luoyang 471003;China;2.China-UK HUST-RRes Genetic Engineering & Genomics Joint Laboratory;Huazhong University of Science & Technology;Wuhan 430074;China
Abstract:With the application of secondary structure prediction,fold-recognition,3D structure modeling and molecular dynamics simulation,three models for the N-terminal domain of HMW-GS 1By15 were built.Analysis of these models revealed two possible ways of disulfide bridges of the five cysteine residues in N-terminal domain of y-type HMW-GS.One way is that Cys22 and Cys44 form an intramolecular disulfide bridge,and the remaining three cysteine residues of N-terminal domain,Cys10,Cys45 and Cys55,act as free residues...
Keywords:Wheat  Glutenin  Homology modeling  Molecular dynamics simulation  Disulfide  
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