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| 玉米PDE191基因全长cDNA的克隆及其生物信息学分析 | |
| 作者单位： | ;1.大理大学基础医学院;2.云南省昆虫生物医药研发重点实验室;3.江苏省仪征市农业委员会;4.云南农业大学高原特色农业产业研究院 |
| 摘 要： | 为研究玉米白化相关基因PDE191序列信息和基因功能,以玉米叶片总RNA逆转录后的c DNA为模板,采用RT-PCR和RACE技术克隆出玉米PDE191基因全长c DNA。DNA测序及生物信息学分析表明,玉米PDE191基因c DNA全长1229 bp,编码333个氨基酸的蛋白质,亚细胞定位于线粒体和叶绿体。软件预测PDE191蛋白分子量为37.79 k D,理论等电点为9.12,该蛋白二级结构主要构成元件为?螺旋和无规则卷曲,包含7个MTERF结构域。三级结构预测显示该蛋白为球状结构,预测结果与二级结构预测的结果相符。对该蛋白进行多重序列比对和聚类分析显示,PDE191属于植物MTERF家族,在不同植物中存在其同源蛋白质,其中与拟南芥PDE191氨基酸序列的相似性高达99%。本研究为进一步研究玉米PDE191基因的功能奠定了基础。 |
| 关 键 词： | 玉米 PDE191基因 全长cDNA 生物信息学分析 |
CLONING AND BIOINFORMATICS ANALYSIS OF FULL LENGTH cDNA OF PDE191 GENE IN ZEA MAYS |
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