粟酒裂殖酵母一个新的box C/D snoRNA的鉴定、功能分析及进化意义 |
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引用本文: | 罗玉萍,周惠,李思光,屈良鹄.粟酒裂殖酵母一个新的box C/D snoRNA的鉴定、功能分析及进化意义[J].科学通报,2004,49(18):1870-1877. |
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作者姓名: | 罗玉萍 周惠 李思光 屈良鹄 |
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作者单位: | 中山大学基因工程教育部重点实验室,广州,510275 |
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基金项目: | 本工作为国家自然科学基金重点基金(批准号:30230200)和国家自然科学基金(批准号:30170216)资助项目. |
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摘 要: | 通过筛选粟酒裂殖酵母核内小分子RNA的cDNA文库,获得了一个新的小分子RNA序列。该RNA具有典型的box C/D snoRNA的保守元件和结构特征,并具有一段与25S rRNA互补的、长度为10个核苷酸的反义序列,推测其可指导25S rRNA G940 位点2’-O-核糖甲基化修饰。经dNTP浓度依赖性引物延伸实验验证,G940确实为2’-O-核糖甲基化修饰位点。功能元件比较分析揭示该snoRNA的上游反义序列与酿酒酵母snR60 的下游反义序列同源,故命名为snR60-Ⅱ。snR60-Ⅱ基因位于一个非编码RNA基因的内含子中,其产物由宿主基因转录后的RNA前体加工而来。这是酵母snoRNA由非编码RNA基因内含子编码的首次报道。通过计算机分析,本研究还从真菌和果蝇中分别发现了一批酵母snR60功能同源分子。在不同生物中,snR60存在独立基因编码、内含子编码和多顺反子转录等多种基因组织形式,表明snR60在进化过程中具有高度的移动性。
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关 键 词: | 粟酒裂殖酵母 box C/D snoRNA RNA甲基化修饰 基因进化 |
收稿时间: | 2004-08-05 |
修稿时间: | 2004-08-17 |
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