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玉米自交系B73铵转运蛋白基因家族分析
引用本文:李红梅,韩国民.玉米自交系B73铵转运蛋白基因家族分析[J].安庆师范学院学报(自然科学版),2018,24(1):73-77.
作者姓名:李红梅  韩国民
作者单位:安徽新华学院信息工程学院,安徽合肥,230088;安徽农业大学生命科学学院,安徽合肥,230088
基金项目:2017年国家青年基金(31600543),安徽新华学院大学生素质教育研究中心2017年度重点科研项目(IFQE201706)
摘    要:以玉米自交系B73全基因组数据为研究材料,运用生物信息学的方法对玉米(Zea mays)AMT基因的数量及特征进行分析。先确定AMT候选基因及其蛋白信息并定位其染色体信息,再通过对其外显子、内含子差异的对比及保守基序motif的分析,得出其系统进化树和电子表达分析。可知玉米B73中共有8个可能的AMT基因,这些基因在染色体上分布不均匀,其中Zm AMT-2,Zm AMT-5和Zm AMT-8均不含内含子,其余5个基因均含有1~2个内含子;Zm AMT基因家族预测的保守motif共有6个,均含有motif 1,2,3,4,5,8,两类基因各自的保守基序数目和位置基本相似;8个AMT基因均在叶子中表达,其中Zm AMT-2,Zm AMT-4,Zm AMT-6和Zm AMT-8在玉米的根中表达,说明这4个基因在玉米根的铵离子吸收过程中可能发挥着重要的作用。

关 键 词:玉米  全基因组  铵转运蛋白  基因预测  特征分析

Analysis of the AmmioniumTransporter Gene Family in Maize Inbred Line B73
LI Hongmei,HAN Guomin.Analysis of the AmmioniumTransporter Gene Family in Maize Inbred Line B73[J].Journal of Anqing Teachers College(Natural Science Edition),2018,24(1):73-77.
Authors:LI Hongmei  HAN Guomin
Abstract:
Keywords:
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