北美五倍子蚜mtDNA COI基因序列遗传分化 |
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引用本文: | 张健,任竹梅,文军.北美五倍子蚜mtDNA COI基因序列遗传分化[J].山西大学学报(自然科学版),2015(2):350-354. |
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作者姓名: | 张健 任竹梅 文军 |
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作者单位: | 山西大学生命科学学院;Department of Botany Smithsonian Institution,National Museum of Natural History,Washington DC,USA |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31170359);国家“863”主题项目(SS2014AA021802);山西省自然科学基金(2012011034-4);山西省回国留学人员科研资助项目(2013-020) |
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摘 要: | 通过测定北美五倍子蚜(Melaphis rhois)3个种群共32个个体的mtDNACOI基因部分序列,分析北美倍蚜种群的遗传结构和变异。在测得的683bp COI基因序列中有75个变异位点(占所测核苷酸序列的11.0%),4种核苷酸T、C、A、G的组成分别为40.2%、15.0%、32.5%和12.3%,具有较高的A+T含量72.7%。M.rhois 32个个体的COI基因序列共产生10个单倍型,其中两个单倍型为主体单倍型,除阿肯色的一个个体与新泽西的6个个体共享一个单倍型外,其余单倍型单独或由同一种群的个体共享。AMOVA分析显示,五倍子蚜种群内核苷酸多样度低,种群间的遗传变异较高,分化显著。TCS网络图和聚类关系显示,五倍子蚜不同单倍型按地理分布形成明显的簇群,其中俄亥俄种群的单倍型单独构成一个分支,与其余两个种群关系较远;俄亥俄种群与其他两种群间的遗传距离也比较大,该种群可能属于五倍子蚜的一个亚种或新种。
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关 键 词: | M.rhois mtDNA COI基因 序列 遗传多样性 |
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