| 基于ISA-ECI参数的肽高效液相色谱保留时间支持向量机预测模型 |
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| 引用本文： | 印家健,崔扬健,邹平.基于ISA-ECI参数的肽高效液相色谱保留时间支持向量机预测模型[J].四川师范大学学报(自然科学版),2007,30(1):94-98. |
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| 作者姓名： | 印家健 崔扬健 邹平 |
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| 作者单位： | 四川农业大学,生命理学院,四川,雅安,625014 |
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| 基金项目： | 致谢 作者衷心感谢四川农业大学生命理学院创新基金的资助. |
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| 摘 要： | 基于氨基酸描述子ISA-ECI,利用加和法构建了101个混杂肽高效液相色谱保留时间的支持向量回归(SVR)预测模型(ε=0.001、σ=4和C=100),并与多元线性回归和投影寻踪回归作了比较研究,结果表明SVR要好于其它方法,SVR方法对数据集留一法交叉检验和拟合的预测复相关系数分别为0.8822和0.9530,其预测结果与实验值一致.且提出了一个简单的方法并指出保留时间与描述肽的分子结构信息的ISA-ECI参数存在着非线性关系.
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| 关 键 词： | 肽 定量结构-保留关系 支持向量机 ISA-ECI参数 |
| 文章编号： | 1001-8395（2007）01-0094-05 |
| 收稿时间： | 2005-12-06 |
| 修稿时间： | 2005年12月6日 |
Prediction Model of Retention Time of Peptides in High-Performance Liquid Chromatography by Support Vector Machine Based on ISA-ECI Parameters |
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| YIN Jia-jian,CUI Yang-jian,ZOU Ping.Prediction Model of Retention Time of Peptides in High-Performance Liquid Chromatography by Support Vector Machine Based on ISA-ECI Parameters[J].Journal of Sichuan Normal University(Natural Science),2007,30(1):94-98. |
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| Authors: | YIN Jia-jian CUI Yang-jian ZOU Ping |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Peptide Quantitative structure-retention relationship Support vector machine ISA-ECI parameter |
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