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基于BioJava的生物序列分析软件的设计
引用本文:唐四薪,李义兵,何红波.基于BioJava的生物序列分析软件的设计[J].河南科技大学学报(自然科学版),2005,26(6):55-58.
作者姓名:唐四薪  李义兵  何红波
作者单位:1. 中南大学,信息科学与工程学院,湖南,长沙,410083
2. 中南大学,物理学院,湖南,长沙,410083
基金项目:国家自然科学基金资助项目(60371046)
摘    要:根据生物信息研究工作中对基因数据处理的实际需要,通过对生物大分子序列分析软件需具备的功能进行分析,并按照面向对象的方法,采用BioJava为开发工具,设计和开发了一个适角于生物序列分析的专用软件(SEQAnalysis),该软件具有独特的序列信息量计算及统计功能,并能将序列分布转化为XML格式,实现了生物信息分析的自动化。

关 键 词:生物大分子序列  基因  生物信息  序列分析
文章编号:1672-6871(2005)06-0055-04
收稿时间:2005-06-10
修稿时间:2005年6月10日

Designing a BioJava-based Software for RNA Sequence Analysis
TANG Si-Xin,LI Yi-Bing,HE Hong-Bo.Designing a BioJava-based Software for RNA Sequence Analysis[J].Journal of Henan University of Science & Technology:Natural Science,2005,26(6):55-58.
Authors:TANG Si-Xin  LI Yi-Bing  HE Hong-Bo
Institution:TANG Si-Xin1,LI Yi-Bing2,HE Hong-Bo2
Abstract:To meet the needs of research in biology,especially for the processing of bioinformational data, the authors designed and implemented a BioJava-based software for RNA sequence analysis, which is the result of analyzing user needs and adopting an object-oriented method.This software makes it possible to automatically process biological data and tremendously reduce the workload of researchers.
Keywords:Biological sequence  Genes  Biochronometry  Sequence analysis
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