| 一种改进的多元回归估计基因调控网络的方法 |
| |
| 引用本文： | 张晗,宋满根,陈国强,骆建华.一种改进的多元回归估计基因调控网络的方法[J].上海交通大学学报,2005,39(2):270-274. |
| |
| 作者姓名： | 张晗 宋满根 陈国强 骆建华 |
| |
| 作者单位： | 上海交通大学,生命科学技术学院,上海,200240;中国科学院,上海生命科学研究院生物信息中心,上海,200031;上海第二医科大学,病理生理学教研室,上海,200025;中国科学院,上海生命科学研究院生物信息中心,上海,200031 |
| |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，国家重点基础研究发展计划(973计划)，上海市科委资助项目，上海交通大学-上海第二医科技大学合作项目 |
| |
| 摘 要： | 针对用多元回归分析估计基因调控网络时遇到的计算量过大的问题,提出了先用线性模型构建基因类间的调控网络,再用多元回归模型构建基因间调控网络的改进方案,利用类间网络提供的参考信息可以大大减少多元回归分析的计算量.将该方案应用到人类基因调控网络的估计中,并通过现有文献验证了部分调控关系,从而初步证明了该方法的有效性.
|
| 关 键 词： | 基因调控网络 多元回归分析 基因表达谱 基因聚类 |
| 文章编号： | 1006-2467(2005)02-0270-05 |
| 修稿时间： | 2004年6月25日 |
An Improved Multiple Regression Analysis for Estimating Gene Regulatory Network |
| |
| ZHANG Han,SONG Man-gen,CHEN Guo-qiang,LUOJian-hua.An Improved Multiple Regression Analysis for Estimating Gene Regulatory Network[J].Journal of Shanghai Jiaotong University,2005,39(2):270-274. |
| |
| Authors: | ZHANG Han SONG Man-gen CHEN Guo-qiang LUOJian-hua |
| |
| Abstract: | For the problem of huge computational amount while using multiple regression analysis to estimate genetic network, an improved method, which is started with an inferred inter-class network of prototype genes and then followed by the modeling of regulatory network between genes by multiple regression analysis, was proposed and applied to the human gene expression data. The effectiveness of the proposed method was preliminarily illustrated by verifying a part of the inferred regulations through existing literatures. |
| |
| Keywords: | gene regulatory network multiple regression analysis gene expression profile gene cluster |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
|
