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代谢型谷氨酸受体mGluR7的基因组结构及其家族蛋白胞外区的基因组结构比较
引用本文:吴清发,董伟,齐晓华,包维东,牛宇欣,张以琳,张海清,陈冲,刘斌,胡松年,汪建,杨焕明.代谢型谷氨酸受体mGluR7的基因组结构及其家族蛋白胞外区的基因组结构比较[J].科学通报,2002,47(7):508-515.
作者姓名:吴清发  董伟  齐晓华  包维东  牛宇欣  张以琳  张海清  陈冲  刘斌  胡松年  汪建  杨焕明
作者单位:[1]中国科学院遗传研究所人类基因组中心,北京100101 [2]北京华大基因研究中心,北京100300
基金项目:本工作为国家高技术研究发展计划资助项目(批准号:863-J19),中国科学院创新工程资助项目(批准号:KSCX1-D4).
摘    要:L-谷氨酸是哺乳动物中枢神经系统中的神经递质,其代谢型丙氨酸受体mGluR7在正常中枢神经功能和多种神经退行性疾病的病理发生中起着重要作用。为了研究mGluR7基因相关疾病的生物和遗传基础,通过从BAC文库中筛选种子克隆和对酶切指纹图谱数据库查询等方法,构建了 覆盖mGluR7全长基因的基因组物理图谱,并采用鸟枪法策略对图中BAC克隆进行测序与拼接组装,最终得到准确度为万分之一的完整的基因组序列。序列分析表明:mGluR7基因是长达880kb的超大基因;其基因组GC含量为38%,重复序列含量为37.5%,由11个外显子和10个内含子组成,其中5个内含子长度超过100kb,内含子1长达285kb; 存在2个替换剪接转录本mGluR7α和mGluR7b。通过比较mGluR7基因家族3组8个亚型受体蛋白胞外区的基因组结构,发现它们对应的基因组结构分为3组,组内各成员的基因组结构较为保守,而组间各成员的基因组结构保守性较差,这种基因组水平的组内保守和组间差异是和蛋白质水平上的保守和差异一致的,提示这些受体的基本功能在进化的过程中有明显的分化。在含mGluR7的组内,尽管组内各成员的基因组结构趋于保守,但大部分含子长度变化幅度很大,揭示基因组结构变化的程度高于蛋白质水平的变化,这种变化预期是在基因表达的调控上体现其生物属性的。

关 键 词:代谢型丙氨酸受体  mGluR7  基因组  结构  家族  蛋白  胞外区
收稿时间:2001-09-17
修稿时间:2001年9月17日
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