响叶杨(杨属)叶绿体基因组测序与比较分析 |
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作者姓名: | 范李强 胡欢 郑洪蕾 王田静 王亚玲 马涛 毛康珊 |
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作者单位: | 四川大学,四川大学,四川大学,四川大学,西北民族大学,四川大学,四川大学 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,省自然科学基金 |
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摘 要: | 本研究中,我们对响叶杨的叶绿体基因组进行测序和组装,并将其与杨属其他11个叶绿体基因组进行比较分析.结果表明,响叶杨叶绿体基因组全长158,591bp,其中两个反向重复序列区(IR)长度均为27,667bp,长单拷贝序列区(LSC)和短单拷贝序列区(SSC)长度分别为84,634和18,623bp.通过对杨属12个物种的叶绿体基因组进行比较,只发现了6个相对较大的插入缺失,因此整体而言,杨属的叶绿体基因组结构是高度保守的.系统发育分析结果显示,杨属中12个物种组成了3个具有高支持率的进化支,响叶杨与其他白杨组物种聚为一支,并且与银白杨的亲缘关系最近.本研究基于叶绿体基因组数据揭示了杨属的进化历史,将有助于进一步开展杨属植物基于叶绿体DNA序列数据的群体遗传学及其他分子生态学研究.
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关 键 词: | 叶绿体基因组 响叶杨 系统发育 |
收稿时间: | 2017-01-10 |
修稿时间: | 2017-04-18 |
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