| 用离散量预测原核生物蛋白质的亚细胞位置 |
| |
| 引用本文： | 陈颖丽,李前忠.用离散量预测原核生物蛋白质的亚细胞位置[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2003,34(5):510-517. |
| |
| 作者姓名： | 陈颖丽 李前忠 |
| |
| 作者单位： | 内蒙古大学理工学院物理系,内蒙古,呼和浩特,010021 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30160025)，内蒙古大学青年科学基金资助项目(202045). |
| |
| 摘 要： | 基于不同亚细胞位置中蛋白质的氨基酸组成及序列信息不同这一观点，以单个氨基酸含量及两两组合氨基酸含量为信息构成离散源，分别计算了原核生物蛋白质三类亚细胞位置的标准离散量D(Z)，D(Xp)，D(Xc)．利用离散增量的概念预测蛋白质的亚细胞位置，它是由这个蛋白质的离散量D(X)与三个标准离散量D(Xc)，D(Xp)，D(Xc)之间离散增量的最小值所决定的．采用Self—consistency检验和Jack—knife检验方法，给出了选择五组不同信息作为离散源中参数时的预测结果．与现有的方法比较，发现用Jack—knife检验法预测extracellular类蛋白质时，给出的离散量方法能够给出最好的预测性能，结果也表明提取更多有效的序列信息是提高预测精度的关键．
|
| 关 键 词： | 蛋白质亚细胞位置 原核生物 离散量 离散增量 |
| 文章编号： | 1000-1638(2003)05-0510-08 |
| 修稿时间： | 2003年3月27日 |
The Subcellular Location Prediction of Proteins in Prokaryotic Organism:Application of the Measure of Diversity |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | proteins subcellular location prokaryotic organism measure of diversity increment of diversity |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
