运用COBRA方法研究聚球藻代谢网络 |
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引用本文: | 赵圆圆,付子爔,申铁.运用COBRA方法研究聚球藻代谢网络[J].贵州师范大学学报(自然科学版),2019,37(3). |
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作者姓名: | 赵圆圆 付子爔 申铁 |
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作者单位: | 贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室,贵州贵阳,550001;贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室,贵州贵阳,550001;贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室,贵州贵阳,550001 |
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摘 要: | 生物过程的系统级建模和模拟,在定量和动态获得细胞功能方面具有指导作用。利用基于约束的代谢网络分析方法在计算机中模拟细胞代谢,分析聚球藻代谢网络的基本拓扑结构和网络内在联系。通过对代谢网络中的反应进行逐一删除,使用FBA和FVA方法分析敲除反应后的代谢网络的流量分布,以及该反应的敲除对其余反应的影响,并找到代谢网络中对整个系统有影响的反应,进一步验证其网络理论和模型方法的可行性。
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关 键 词: | 基于约束的重建和分析方法 流量平衡分析 流量可变性分析 代谢网络 聚球藻 |
Research the metabolic network of Synechococcus by COBRA |
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