| 一个植物跨膜蛋白DUF872基因家族新成员的克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 周建平,杨足君,李光蓉,刘朝辉,刘成,任正隆.一个植物跨膜蛋白DUF872基因家族新成员的克隆与序列分析[J].四川大学学报(自然科学版),2008,45(1):371-376. |
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| 作者姓名： | 周建平 杨足君 李光蓉 刘朝辉 刘成 任正隆 |
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| 作者单位： | 电子科技大学生命与技术学院;电子科技大学生命与技术学院;电子科技大学生命与技术学院;电子科技大学生命与技术学院;电子科技大学生命与技术学院;电子科技大学生命与技术学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(30170502、30170579)；国家863资助项目(2001AA241034)；教育厅重点项目(2004A020) |
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| 摘 要： | DUF872家族是由一些未被具体描述的真核生物蛋白质构成,该家族的基因功能尚不清楚.本研究通过PCR方法从手掌参全长cDNA文库中筛选到了一个DUF872家族基因的全长cDNA,暂命名GcDUF872-1或Gc364.测序表明该序列长度为618 bp,推测编码103个氨基酸的蛋白质,序列比对表明它与拟南芥和水稻的DUF872家族基因蛋白质的相似程度达到85.92%.DUF872基因家族的进化分析表明Gc364与水稻、拟南芥的遗传关系最近,同属一个亚家族.半定量RT-PCR显示Gc364在植物组织中表达量较低,属于低丰度表达的基因,而且表达量受光处理而上调.生物信息学分析表明预测蛋白Gc364属于两次跨膜的蛋白质,可能是一个真正的编码蛋白,主要参与信号传递或能量的转换.
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| 关 键 词： | 手掌参 DUF872家族 半定量RT-PCR 生物信息学 |
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