| 配体和受体间的结合自由能的计算方法 |
| |
| 引用本文： | 杨忠志,刘慧波.配体和受体间的结合自由能的计算方法[J].辽宁师范大学学报(自然科学版),2008,31(4). |
| |
| 作者姓名： | 杨忠志 刘慧波 |
| |
| 作者单位： | 1. 辽宁师范大学,化学化工学院,辽宁,大连,116029
2. 辽宁师范大学,物理与电子技术学院,辽宁,大连,116029 |
| |
| 摘 要： | 精确地预测配体和受体间的结合自由能是计算化学中最重要的问题之一.首先,从未知受体三维结构和已知受体三维结构2个角度出发,评述计算配体和受体间结合自由能的各种方法及其优缺点;其次,分析计算结合自由能过程中长期存在问题与挑战,包括势能函数模型和溶剂化模型的合理建立,配体与受体结合过程中平动熵、转动熵、构型熵变化的精确计算;最后,研究应用ABEEM/MM力场结合GBSA和LIECE方法进行结合自由能的计算.
|
| 关 键 词： | 结合自由能 熵损 势能函数 ABEEM/MM 溶剂化模型 受体 配体 |
Methods of calculating binding free energies of ligands and receptors |
| |
| YANG Zhong-zhi,LIU Hui-bo.Methods of calculating binding free energies of ligands and receptors[J].Journal of Liaoning Normal University(Natural Science Edition),2008,31(4). |
| |
| Authors: | YANG Zhong-zhi LIU Hui-bo |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | ABEEM/MM |
| 本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录！ |
|
