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通过权重共表达网络分析胰腺癌转移的特异基因网络
引用本文:唐婧,程美玲,肖玉凤,邓志芬,李菁.通过权重共表达网络分析胰腺癌转移的特异基因网络[J].贵州师范大学学报(自然科学版),2020,38(3):39-44,89.
作者姓名:唐婧  程美玲  肖玉凤  邓志芬  李菁
作者单位:贵州师范大学,贵州省植物生理与发育重点实验室,生命科学学院,贵州 贵阳 550025,贵州师范大学,贵州省植物生理与发育重点实验室,生命科学学院,贵州 贵阳 550025,贵州师范大学,贵州省植物生理与发育重点实验室,生命科学学院,贵州 贵阳 550025,贵州师范大学,贵州省植物生理与发育重点实验室,生命科学学院,贵州 贵阳 550025,贵州师范大学,贵州省植物生理与发育重点实验室,生命科学学院,贵州 贵阳 550025
基金项目:贵州师范大学博士科研项目;重庆市教育委员会青年项目;国家自然科学基金委员会-贵州省人民政府喀斯特科学研究中心项目
摘    要:胰腺癌是一种高度恶性的消化道肿瘤,临床表现不具有特征性,在早期难诊断易转移,发展迅速;胰腺癌转移率高,且转移后难以治愈进而导致死亡率升高。因此相比胰腺癌未转移来说,研究确定预测胰腺癌转移、转移后的新治疗方法及治疗的潜在靶标尤为迫切并具有重要意义。而且近两年兴起的基于基因之间相关关系的共表达网络分析法,为多种复杂疾病的研究提供了新的线索和思路。我们应用TCGA数据库中的大量胰腺癌转录组数据,筛选胰腺癌转移差异表达基因,使用共表达网络分析法(WGCNA)筛选胰腺癌转移后,基因间出现一个52个差异表达基因构建的新共表达网络模块,且挖掘到其中ASIC4,GLDC,MMD2,CTNNA2,FOXC4-AS1,SNHG19和BCAN等11个枢纽基因。我们推测认为它们为胰腺癌转移提供了新的潜在诊断、治疗靶标。同时KEGG富集分析发现,该新基因网络模块内基因富集于炎症介质对色氨酸通道的调节,卵母细胞减数分裂,乙醛酸和二元羧酸盐代谢和甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢等4条代谢通路。

关 键 词:胰腺癌转移  WGCNA  基因网络  差异基因

Analysis of metastasis specific gene network of pancreatic cancer by weight co-expression network
TANG Jing,CHENG Meiling,XIAO Yufeng,DENG Zhifen,LI Jing.Analysis of metastasis specific gene network of pancreatic cancer by weight co-expression network[J].Journal of Guizhou Normal University(Natural Sciences),2020,38(3):39-44,89.
Authors:TANG Jing  CHENG Meiling  XIAO Yufeng  DENG Zhifen  LI Jing
Abstract:
Keywords:
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