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杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心蛋白D2 基因的克隆及序列分析
引用本文:刘红涛,宋建伟,臧卫东,鲁照明,王鹏举,薛乐勋.杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心蛋白D2 基因的克隆及序列分析[J].华中师范大学学报(自然科学版),2007,41(3):431-436.
作者姓名:刘红涛  宋建伟  臧卫东  鲁照明  王鹏举  薛乐勋
作者单位:郑州大学,医学实验中心,郑州,450052
摘    要:根据莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、Oryza sativa、Chlorella vulgaris以及Mesostigma viride 等真核生物的psbD基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用TRIzol试剂提取杜氏盐藻(Dunaliella salina)细胞的总RNA,通过RT-PCR,得到杜氏盐藻cDNA片段的长度大约为1 000bp.该序列的PCR产物经T-A克隆并测序分析以及测序结果推导成氨基酸序列,Blast同源性分析表明所克隆的基因为杜氏盐藻psbD基因,编码杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心D2蛋白,该序列已递交GenBank(GenBank登录号为:DQ074450).编码的氨基酸序列,同源性依次为:Chlamydomonas reinhardtii 92%,Nephroselmis olivacea 88%,Pinus thunbergii 88%,Amborella trichopoda 88%,Chlorella vulgaris 88%.通过密码子偏爱性分析表明,psbD基因存在明显的密码子偏爱性,其(A T)含量明显高于(G C)含量.

关 键 词:杜氏盐藻  D2蛋白  psbD  简并引物  密码子偏爱性  杜氏盐藻  系统Ⅱ  反应中心  中心蛋白  基因  克隆  序列分析  photosystem  analysis  Cloning  Dunaliella  salina  protein  center  含量  存在  密码子偏爱性  Pinus  thunbergii  登录号  GenBank
文章编号:1000-1190(2007)03-0431-06
修稿时间:2007-01-22

Cloning and analysis of cDNA of photosystem Ⅱ reactor center protein D2 of Dunaliella salina
LIU Hongtao,SONG Jianwei,ZANG Weidong,LU Zhaoming,WANG Pengju,XUE Lexun.Cloning and analysis of cDNA of photosystem Ⅱ reactor center protein D2 of Dunaliella salina[J].Journal of Central China Normal University(Natural Sciences),2007,41(3):431-436.
Authors:LIU Hongtao  SONG Jianwei  ZANG Weidong  LU Zhaoming  WANG Pengju  XUE Lexun
Institution:Expermental Center for Medicine, Zhengzhou University, Zhengzhou 450052
Abstract:
Keywords:Dunaliella salina  D2 proteins  psbD gene  degenerate primer  codon bias
本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录!
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