锌指结构域序列的进化生成模拟——遗传算法在蛋白质结构研究中的应用 |
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作者姓名: | 孙之荣 韩浩 |
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作者单位: | 清华大学生物科学与技术系,生物膜与膜工程国家重点实验室 北京 100084 |
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摘 要: | <正> 遗传算法(Genetic algorithms, GA)是具有高频率的搜索机制的算法.遗传算法不仅为蛋白质结构研究提供了一种全局自适应搜索算法,使能量最低状态(按热力学假说,蛋白质的天然状态的能量最低)的搜索更加方便,而且为我们提供了一种新的想法和研究思路.通过应用遗传算法对锌指结构域序列进行进化模拟,成功地从随机产生的氨基酸序列中,进化生成了一些潜在的锌指结构域序列,不仅在一定意义上证明了氨基酸序列起源的随机性,而且对遗传算法在大规模解空间的搜索能力进行了测试.
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关 键 词: | 遗传算法 锌指结构域 进化模拟 蛋白质结构 |
收稿时间: | 1996-11-30 |
修稿时间: | 1997-02-15 |
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