| 逐步预测和统计学筛选人H_5N_1毒株神经氨酸酶蛋白B细胞表位 |
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| 引用本文： | 黄平,俞守义,柯昌文.逐步预测和统计学筛选人H_5N_1毒株神经氨酸酶蛋白B细胞表位[J].科学通报,2008(22). |
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| 作者姓名： | 黄平 俞守义 柯昌文 |
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| 作者单位： | 广东省疾病预防控制中心;广东省应急病原学检测重点实验室;世界卫生组织新发传染病监测、研究和培训合作中心;南方医科大学流行病学系; |
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| 基金项目： | 广东省科技项目(批准号:2004A2090102)资助 |
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| 摘 要： | 为了预测和筛选人禽流感H5N1毒株神经氨酸酶(NA)蛋白的B细胞表位,检测了人禽流感H5N1毒株NA基因核苷酸序列.采用Kyte-Doolittle的亲水性方案、Emini方案和Jameson-Wolf抗原指数方案,辅以对NA蛋白的二级结构中的柔性区域的分析,并用SPSS13.0进行聚类和相关分析,建立了一种统计学筛选程序,预测了H5N1病毒NA蛋白的B细胞表位,并对毒株GD-01-06的NA蛋白变异进行了分析.预测结果通过吴氏抗原指数和SWISS-MODEL软件进行评价.结果发现,预测并筛选最有可能的B细胞表位位于NA蛋白N端第120～137,81～84,408～415,273～282,429～432,356～368,46～55,146～155,341～350,198～209肽段,提示它们是B细胞表位的优势区段;含有糖基化位点NGT126～128的120～137肽段为首选的NA蛋白抗原表位;H5N1毒株NA蛋白第53位(Ⅰ)位点缺失,这有助于增加毒株GD-01-06的NA蛋白表面柔性,而且抗原表位扩大(VEP46～48→VEPISNTNFL46～55).采用SWISS-MODEL软件建立的N1蛋白模型有助于...
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| 关 键 词： | H5N1病毒 神经氨酸酶（NA） B细胞表位 预测 筛选 |
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