| 线粒体上核糖核蛋白基因内含子与相应编码序列的相互作用分析 |
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| 引用本文： | 李宏,赵雯,陈旭,王荣,赵小庆.线粒体上核糖核蛋白基因内含子与相应编码序列的相互作用分析[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2013(5):515-524. |
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| 作者姓名： | 李宏 赵雯 陈旭 王荣 赵小庆 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学物理科学与技术学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31260219);内蒙古大学本科生创新培养基金项目资助 |
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| 摘 要： | 剪切后的内含子对基因的表达调控过程仍发挥着重要的作用,发现内含子通过与相应mRNA的相互作用来实现这些功能的.用改进后的Smith-Waterman算法进行局域比对,对线虫、果蝇、小鼠和人类的线粒体上核糖核蛋白基因的内含子与相应编码序列做匹配性比对分析,发现内含子的中部序列与编码序列存在较强的相互作用,三类内含子上的匹配频率分布显示了各自的特征.在编码序列上有多个最佳匹配区域和禁配区域,推测这些禁配区域可能是蛋白质复合体的结合区域.最佳匹配片段的GC含量分布范围较广,覆盖了其它三类序列分布范围.高等真核生物最佳匹配片段的平均长度比低等真核生物要长一些.结论表明最佳匹配片段的序列特征符合RNA-RNA相互作用的一般规律,内含子应该是一类调控基因表达的功能片段.
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| 关 键 词： | 线粒体 核糖核蛋白基因 内含子 编码序列 局域比对 最佳匹配片段 GC含量 |
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