| 基于分子对接研究小分子对冰核蛋白的微观抑制机理 |
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| 引用本文： | 胡响响,丁雅丽,冯玄,张然,石彤非,卫来.基于分子对接研究小分子对冰核蛋白的微观抑制机理[J].华东理工大学学报(自然科学版),2022,48(1):1-7. |
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| 作者姓名： | 胡响响 丁雅丽 冯玄 张然 石彤非 卫来 |
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| 作者单位： | 伊犁师范大学物理科学与技术学院,新疆凝聚态相变与微结构实验室,新疆 伊宁 835000;中科院长春应用化学研究所,高分子物理与化学国家重点实验室,长春 130022;中国科学技术大学应用化学与工程学院,合肥 230026;中科院长春应用化学研究所,高分子物理与化学国家重点实验室,长春 130022 |
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| 摘 要： | 使用分子模拟软件AutoDock研究了甘油和三聚甘油分子与北方假单胞菌的冰核蛋白(PbINP)模型之间的相互作用,以期阐释聚甘油对冰核细菌丁香假单胞菌冰核蛋白(INP)冰成核抑制行为的分子机理,以及该机理是否在INP类结构中具有普适性.模拟结果显示了配体分子与TXT(T表示苏氨酸,X表示其他残基)结冰模板和酪氨酸(TYR)阶梯结构之间的不同结合能力,并且在配体与TXT结冰模板的结合中发现有INP的其他残基参与结合.表明配体分子与INP的特异性结合可能适用于其他具有类似结构的INP.该结果为聚甘油作为冷冻保护材料的开发和进一步理解INP的结冰机理提供了有用的理论信息.
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| 关 键 词： | 冰核蛋白 分子建模 AutoDock 聚甘油 北方假单胞菌 |
Microscopic Inhibition Mechanism of Small Molecules on Ice Nucleation Protein Based on Molecular Docking |
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| HU Xiangxiang,DING Yali,FENG Xuan,ZHANG Ran,SHI Tongfei,WEI Lai.Microscopic Inhibition Mechanism of Small Molecules on Ice Nucleation Protein Based on Molecular Docking[J].Journal of East China University of Science and Technology,2022,48(1):1-7. |
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| Authors: | HU Xiangxiang DING Yali FENG Xuan ZHANG Ran SHI Tongfei WEI Lai |
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