| 一种改良的蛋白质复合物识别方法 |
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| 引用本文： | 李彬,栾悉道,王鑫,李学勇.一种改良的蛋白质复合物识别方法[J].长沙大学学报,2015(2):32-35. |
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| 作者姓名： | 李彬 栾悉道 王鑫 李学勇 |
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| 作者单位： | 长沙大学信息与计算科学系,湖南 长沙,410022 |
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| 基金项目： | 湖南省教育厅项目(批准号10C0408)；教育厅科学研究项目(批准号10B010)；科技厅计划项目 |
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| 摘 要： | 高通量的方法产生了大量蛋白质相互作用数据.然而研究表明,对于已过滤的双杂交酵母数据集,假阳性相互作用的比例达到50%左右.这些假阳性这对于进一步的PPI网络研究带来了负面影响.因此,消除假阳性或者降低假阳性带来的负面影响变得非常重要.根据蛋白质相互作用网络的拓扑特性,每一组相互作用被赋予一个存在概率,概率值表示相互作用的可靠程度,概率值为0的相互作用被标识为假阳性予以消除.提出了一种改良的蛋白质复合物识别方法,该方法基于核-附件的思想,识别的复合物具有更强的生物统计特性.改良的新方法及其他经典的识别方法在酵母数据集上得到运行,实验结果表明,改良的方法性能优于现有的经典方法.
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| 关 键 词： | 蛋白质相互作用网络 蛋白质复合物 假阳性 酵母 |
An Improved Method for Protein Complexes Predicting |
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| LI Bin,LUAN Xidao,WANG Xin,LI Xueyong.An Improved Method for Protein Complexes Predicting[J].Journal of Changsha University,2015(2):32-35. |
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| Authors: | LI Bin LUAN Xidao WANG Xin LI Xueyong |
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| Institution: | LI Bin;LUAN Xidao;WANG Xin;LI Xueyong;Department of Information and Computing Science,Changsha University; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | protein -protein interaction network protein complex false positive yeast |
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