基于基因表达谱的黑腹果蝇组织标志基因的鉴定

【目的】为解决目前黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）组织标志基因鉴定结果不统一、不准确的问题。【方法】分别利用Fly Cell Atlas和 FlyAtlas2数据库中7个共有组织的转录组学数据,通过Seurat以及计算差异表达倍数的方法鉴定果蝇组织标志基因。经过跨数据集交叉验证,文献比对和基因功能检索,最终确定准确的标志基因。【结果】从两个数据集中分别鉴定出575和5202个标志基因,经跨数据集交叉验证后得到366和2671个标志基因,通过文献比对和FlyBase数据库基因功能检索,共得到55个核心组织标志基因和23个候选组织标志基因。【结论】建立了准确的果蝇组织标志基因集,为将来果蝇组织类型区分和细胞类型标志基因鉴定提供了重要参考。