| 基于COⅠ基因和D-loop序列的东海鳓鱼种质资源遗传变异研究 |
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| 引用本文： | 李鹏飞,贺舟挺,徐开达,朱文斌,薛利建,张洪亮.基于COⅠ基因和D-loop序列的东海鳓鱼种质资源遗传变异研究[J].浙江海洋学院学报(自然科学版),2013,32(2). |
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| 作者姓名： | 李鹏飞 贺舟挺 徐开达 朱文斌 薛利建 张洪亮 |
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| 作者单位： | 浙江海洋学院海洋与渔业研究所,浙江省海洋水产研究所,浙江舟山316100 |
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| 基金项目： | 科研院所优秀青年科技人才资助计划项目，国家科技支撑计划项目，国家科技支撑计划项目，海洋公益性行业科研专项经费项目 |
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| 摘 要： | 以东海区鳓鱼背部肌肉的线粒体DNA作为模板,对16个个体的CO Ⅰ基因和D-loop序列进行了扩增,通过对PCR产物进行双向测序,最终得到了691 bp的CO Ⅰ基因片段和718 bp的D-loop序列片断.用DNASP软件分析得知,16个CO Ⅰ基因序列定义了6个单倍型(在GenBank登录号:HM030765-HM030768,HM030769-HM030770),在6个单倍型中,共检测到6个变异位点,其中有5个变异位点发生在第三密码子位置上,有1个变异位点发生在第一密码子位置上.东海区鳓鱼16个个体D-loop序列共定义了14个单倍型(GenBank登录号:HM030781,HM030783-HM030792,HM030794-HM030796).除去插入/缺失位点,14个单倍型共检测到30个多态位点,主要发生在D-loop序列的两端区域；D-loop序列还检测到80个插入或缺失位点,碱基插入主要发生在340～419 bp之间的中央区域,以40 bp重复片断插入的形式进行.每个个体含有2～4个连续重复片断.对鳓鱼进行了遗传多样性分析,CO Ⅰ基因序列的单倍型多样性为0.617,核苷酸多样性指数为0.001 37,平均核苷酸差异数为0.950.D-loop序列的单倍型多样性为0.983,核苷酸多样性指数为0.009 98,平均核苷酸差异数为6.367.综合分析,东海区鳓鱼的遗传多样性并不高,有必要采取综合措施对其进行种质资源保护.
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| 关 键 词： | 东海 鳓鱼 COⅠ基因 D-loop序列 种质资源 遗传变异 |
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