藜麦热激蛋白60(CqHSP60)基因家族生物信息学和表达模式分析 |
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引用本文: | 陈方军,刘文莉,杨博,彭悦,丁洪霞,宫瑗,尹海波,郭善利.藜麦热激蛋白60(CqHSP60)基因家族生物信息学和表达模式分析[J].烟台大学学报(自然科学与工程版),2024(2):155-162. |
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作者姓名: | 陈方军 刘文莉 杨博 彭悦 丁洪霞 宫瑗 尹海波 郭善利 |
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作者单位: | 烟台大学生命科学学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(31370296); |
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摘 要: | 为了探究藜麦HSP60基因(CqHSP60)的结构特征、基因功能和表达模式,基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学方法对CqHSP60基因家族进行鉴定和系统分析。依据亚细胞结构定位分为了三个亚组,每个亚组具有相似的Motif和基因结构;通过RNA-Seq数据对CqHSP60基因在不同发育阶段进行了表达分析,并对在热、干旱、盐胁迫等不同处理条件下CqHSP60基因的胁迫响应进行了分析,结果表明CqHSP60基因在花簇和干种子中表达量较高,并对不同的胁迫模式均有响应;在CqHSP60基因的启动子区发现了多个与胁迫相关的顺式调控元件,这表明这些基因在多重胁迫下受到应激响应。
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关 键 词: | 藜麦 HSP60 表达模式 胁迫 伴侣蛋白 |
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