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藜麦热激蛋白60(CqHSP60)基因家族生物信息学和表达模式分析
引用本文:陈方军,刘文莉,杨博,彭悦,丁洪霞,宫瑗,尹海波,郭善利.藜麦热激蛋白60(CqHSP60)基因家族生物信息学和表达模式分析[J].烟台大学学报(自然科学与工程版),2024(2):155-162.
作者姓名:陈方军  刘文莉  杨博  彭悦  丁洪霞  宫瑗  尹海波  郭善利
作者单位:烟台大学生命科学学院
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31370296);
摘    要:为了探究藜麦HSP60基因(CqHSP60)的结构特征、基因功能和表达模式,基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学方法对CqHSP60基因家族进行鉴定和系统分析。依据亚细胞结构定位分为了三个亚组,每个亚组具有相似的Motif和基因结构;通过RNA-Seq数据对CqHSP60基因在不同发育阶段进行了表达分析,并对在热、干旱、盐胁迫等不同处理条件下CqHSP60基因的胁迫响应进行了分析,结果表明CqHSP60基因在花簇和干种子中表达量较高,并对不同的胁迫模式均有响应;在CqHSP60基因的启动子区发现了多个与胁迫相关的顺式调控元件,这表明这些基因在多重胁迫下受到应激响应。

关 键 词:藜麦  HSP60  表达模式  胁迫  伴侣蛋白
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